1957(民國46)年10月10日，中國國民黨召開八全大會，確定以建設臺灣準備反攻為今後努力方針。革命實踐研究院教育為應此一新階段之要求，即籌劃第三階段教育計劃以期儲備黨政軍聯合作戰之領導人才，並培植大陸革命之工作幹部，準備完成反攻復國之偉大革命。革命實踐研究院原擬設立「國家戰略研究部」「國家建設研究部」「大陸革命工作幹部訓練班」等三個機構，徐棓根委員提出建議，約參謀總長王叔銘等共同商討，經決定將國防大學正籌備中之國防研究系與革命實踐研究院第三階段教育合併實施，更名為「國防研究院」。先後調集國防研究系原有籌備人員，並增聘學者專家，進行研擬國防研究院籌備計劃綱要草案，及第一期教育計劃大綱草案兩種，於1958(民國47)年7月25日簽奉　蔣中正總裁兼院長批示照准施行，此國防研究院創立之由來。
國防研究院與美國國家戰爭學院同一性質，為國家政略、戰略之研究機構，研擬中之國防研究院組織，擬隸屬於總統府，經於1959(民國48)年1月14日呈報籌備工作概況一案中簽奉　總裁兼院長核定，與總統府秘書長張群洽商有關細節後，遂於3月12日檢具國防研究院組織系統編制表、教育計劃大綱、課程內容課目一覽表、經費預算表等，簽奉　核頒組織綱要及印信等件。國防研究院院長一職，由　總統親兼，並特任張其昀先生為主任，3月25日奉核定鄧文儀等56人為第一期研究員。4月1日國防研究院正式成立，隨即辦理召集命令，於4月15日正式開學，為我國之文武綜合教育最高學府。